基于网络药理学的研究方法,探究舒筋活血胶囊治疗骨质疏松症发挥药效的化学成分及其作用的基因靶点与信号通路。在TCMSP数据库中逐一输入舒筋活血胶囊各单味药材名称,收集各味药材目前收录于该数据库的所有化学成分,根据其ADME(吸收、分布、代谢、排泄)OB≥30%,DL≥0.18,CACO-2≥0.4,BBB≥-0.3对化学成分的类药性进行评分,选出其中的活性成分。舒筋活血胶囊中总共筛选出16个活性化合物,见表2,其中红花8个活性化合物、香加皮3个活性化合物、络石藤3个活性化合物、伸筋草3个活性化合物、鸡血藤6个活性化合物、泽兰2个活性化合物、香附3个活性化合物,槲寄生3个活性化合物,狗脊中并无活性成分。
判断中药复方有效性的指标是靶点的有无及作用的强弱,将收集的所有活性化合物输入到Genecards数据库,收集所有活性成分和疾病“Osteoporosis”靶点,筛选出每个化合物与疾病“Osteoporosis”的相同靶点。故在Uniprot数据库中,输入整理的相同靶点基因名称进行检索,得到基因的ID。将上述获得的基因的ID输入到DAVID数据库,进行KEGG通路富集分析,富集分析后将所得的结果设置成FDR<0.05、P<0.01作为显著性强的标准进行筛选,筛选出重要的信号通路并分析。
将上述活性成分、基因靶点、信号通路相互作用的数据整理成表格。整理药材和活性成分、活性成分与靶点、靶点与信号通路之间的相互关系。将上述数据联系导入Cytoscape软件中,得到“药材-化合物成分-基因靶点-信号通路”之间相互作用和关联的网络图(见图3)。
收集各化合物和疾病Osteoporosis的基因靶点,其中疾病Osteoporosis的靶点基因4078个,化合物与疾病相同基因靶点有184个。得到的相同的基因靶点ID输入到DAVID数据库中,舒筋活血胶囊中所有化合物涉及的184个靶点基因分析了83.9%通路,所作用的信号通路信息共135条,以FDR<0.05、P<0.01筛选出78条通路,选择前23条信号通路分析,其具体信息如表格3所示,舒筋活血胶囊里的有效成分通过这些通路来实现治疗骨质疏松症的目的。
如图3所示,从上至下依次为舒筋活血胶囊的单味药材、药材中发挥作用的活性成分、活性成分所作用的基因靶点、基因靶点所涉及的信号通路。该图直观的呈现出舒筋活血胶囊中“药材-化合物成分-基因靶点-靶点通路”之间的关系。
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